A、基因内部结构的改变即基因突变，基因突变后基因的数目不变，A错误；

B、染色体结构变异中的片段的增添会导致该染色体上多几个基因，片段的缺失会导致该染色体上少几个基因，B正确；

C、染色体数目的变异会导致该染色体上的所有基因增多或减少，C错误；

D、基因重组是位于非同源染色体上的非等位基因的组合或同源染色体之间交换互换基因，不会改变基因的数目，D错误．

故选：B．