物质的组成和结构涉及多个层面，从基本粒子到复杂的分子实体。以下是这些概念之间关系的描述：

1. 元素是由具有相同原子序数的原子组成的一类物质，这是它们最基本的特征。

2. 原子是构成所有物质的基本粒子，包含原子核和核外电子。原子核由质子和中子组成，不过并非所有原子都含有中子。

3. 分子是由两个或多个原子通过化学键连接在一起构成的最小粒子，能够独立存在并保持化合物的化学性质。

4. 离子是带电的原子或分子，它们通过得失电子而获得电荷。

5. 中子是构成原子核的粒子之一，与质子一起存在于原子核中，但并不都存在于所有原子中。

6. 电子是带有负电的粒子，围绕原子核运动，它们决定了原子的化学性质。

7. 原子核是原子的中心部分，由质子和中子组成，质子数决定了元素的种类。

因此，分子是由原子组成的，而原子又由原子核和电子构成。原子核由质子和中子组成，而电子则可以在原子核周围运动。元素是由相同原子序数的原子组成的，而离子则是通过电子的得失而带电的原子或分子。这些概念共同构成了我们理解物质构成的基础。