1948年济南解放时，全市五万回民，无一所回族中等学校，建国后，党和政府非常关心民族教育，决定建立济南回民中学。

1951年9月，济南第一所回民中学正式建立，暂借清真南大寺作为校舍。1952年，实现全省招生。

为改善办学环境，学校建校初先后三次迁校。1958年政府拨专款在民生大街建起3500平方米教学大楼。1959年秋，全校师生在喜庆的锣鼓声中喜迁新苑。

1960年秋，学校更名为“山东省济南第六中学”，停止全省招生，由单招回族学生改为回汉兼收。

1981年12月19日，济南市政府决定恢复山东省济南回民中学的校名，并隆重召开复名大会。副省长李予昂亲自题写校碑。

1983年7月，学校被确定为山东省重点中学。

进入新世纪以来，学校顺应时代发展，采取有力措施抓办学质量的提升，全体回中人群情振奋，斗志昂扬，学校各方面工作均呈现生机勃勃的新局面。

学校坚持以学生发展为本，以“让每一位学生都能得到良好发展，都能体验到成功的喜悦”为育人理念，以“勤”为立校之本、强学之基，扎实推进素质教育，促进学生全面发展。

学校占地面积18000多平方米，有规范化的教学楼、现代化的实验楼、新建的塑胶体育场，育人环境优雅，文化氛围浓厚。学校基础设施完备，教学设备先进，被评为山东省电化教育示范学校和山东省实验教学达标学校。

济南回民中学，环境优雅，人气旺盛，校风良好，质量提升

，社会形象有了显著提高，凡走进回中的人都会感到清风拂面、环境宜人、人际关系和谐、教学秩序井然。一个青春焕发、魅力无限的新回中正在崛起。

2006年学校制订了三年发展规划，把目标 定位在“创建一所民族特色明显、教育质量优异、社会声誉较高、在省内具有一定知名度的完全中学。”提出了崭新的办学理念：让回中的每一个学生都能得到良好发展，都能体验到成功的喜悦。从此，回中全体职工励精图治，开始了艰苦的努力、艰难的跋涉、竭尽全力的奋斗，圆满完成了既定的任务，基本实现了三年阶段性目标，并为实现长远目标奠定了坚实的基础。