在特殊疑问句中，判断主语通常依赖于疑问词的位置和句子的语序。

以下是一些判断主语的方法：

1. **疑问词作为主语**：当疑问词直接作为句子的主语时，句子的语序不会改变，即be动词或助动词不会提前。例如，将"Something is wrong with you."变为特殊疑问句时，疑问词"what"替代"something"，句子变为"What is wrong with you "，此时"what"就是主语。

2. **疑问词非主语时**：如果疑问词不是主语，而是其他成分（如宾语、定语等），则通常需要将be动词或助动词提前到主语之前。例如，"Your name is Tim."变为特殊疑问句时，疑问词"what"提前，句子变为"What is your name "，此时"your name"是主语。

3. **复合句中的主语**：在复合句中，尤其是宾语从句的情况下，宾语从句中谓语动词前面的人或事物通常是主语。例如，在"I want to know what you often do."中，"you"是宾语从句的主语。

4. **特殊情况**：有些疑问词如"who"、"what"、"which"、"whose"等既能引导特殊疑问句，又能在特殊疑问句中作主语。例如，"What is wrong with your phone "中的"what"就是主语。

5. **be动词的情况**：在包含be动词的句子中，判断主语可能会有些困难，因为be动词可以提前或不提前。例如，"His girlfriend is Anna."变为特殊疑问句可以是"Whose girlfriend is Anna "或"Who is Anna "，具体取决于疑问词的选择和语境。

6. **高级阶段的分析**：在英语学习的高级阶段，判断主语可能需要更深入地分析句子成分和语境。

总的来说，判断特殊疑问句中的主语需要考虑疑问词的功能和位置以及句子的语序。通过练习和阅读更多的例句，可以更好地掌握这一语法点。