种子的结构主要包括种皮、胚和胚乳三部分。其中，胚是种子的核心部分，由胚芽、胚轴、胚根和子叶四要素构成。根据胚乳的存在与否，种子分为有胚乳种子和无胚乳种子两种类型。植物根据种子中子叶的数量，分为单子叶植物和双子叶植物。

胚芽、胚轴、胚根和子叶构成了胚，是种子中最重要的部分。在双子叶植物中，胚包括这四部分；而在单子叶植物中，胚包括胚芽、胚轴、胚根和胚乳。胚乳是种子中储存营养的部分，其存在与否和形态因植物种类而异。

种皮是种子的外层保护结构，由珠被发育而来。裸子植物的种皮由三层组成：外层和内层为肉质层，中层为石质层。裸子植物的种子外部没有果皮。

子叶是种子内的储存组织，形态多样，有的细长、扁平，有的肥厚且肉质，如花生和菜豆，有的则成薄片状，如蓖麻。子叶在种子内部可能多次折叠，如棉花。子叶为种子的发育提供营养，并在种子萌发时支持胚的生长。

在种子发育过程中，胚囊体积逐渐扩大，珠心组织受到破坏，最终被胚和胚乳吸收，因此在成熟的种子中通常没有珠心组织。然而，某些植物的珠心组织在种子发育过程中保留下来，并储存养分，形成外胚乳。例如，菠菜和甜菜的成熟种子具有外胚乳，而胡椒和姜的成熟种子则同时具有胚乳和外胚乳。