在番禺区，有多所国家级示范性普通高中，其中广州市铁一中学因其悠久的历史和卓越的教学质量而备受关注。广州市铁一中学创建于1952年，是广东省首批省一级学校之一，也是国家级示范性普通高中。学校拥有两个校区，越秀校区和亚运城校区，后者创建于2012年，为广州市直属公办完全中学。

广州大学附属中学也是番禺区的一所重要高中。这所学校同样历史悠久，创建于20世纪50年代，是广东省首批省一级学校和国家级示范性普通高中。广州大学附属中学不仅拥有越秀本部，还有大学城校区，后者于2010年正式投入使用。

广东仲元中学则是另一所备受推崇的高中，创建于1934年，是广东省首批省一级学校和首批国家级示范性普通高中。近年来，学校计划新建第二校区，旨在扩大规模，提升教育质量。

广东番禺中学同样具有较高声誉，创建于1988年，是广东省首批省一级学校和国家级示范性普通高中。学校在2003年兴建了第二校区，并于2010年独立成校。

番禺区禺山高级中学则有悠久的历史，创办于1906年，前身为番禺师范学校。学校在2000年转制为普通高中，并于2004年通过省一级学校认证，2012年成为国家级示范性普通高中。

番禺区象贤中学则是一所历史悠久的学校，创建于1826年，曾几经更名。学校在2002年通过省一级学校认证，2011年成为国家级示范性普通高中。

广东第二师范学院番禺附属中学则是在2010年改制而成，成为番禺区政府与广东第二师范学院共建共管的高中。学校同样具有较高声誉，是广东省一级学校和国家级示范性普通高中。