北京自主招生的学校有：北京大学、清华大学、北京航空航天大学等。

1. 北京大学：北京大学是我国的顶尖学府之一，拥有广泛的自主招生权限。学校根据自身的需求和特点，制定了一套完整的自主招生体系，旨在选拔具有特殊才能和潜力的学生。

2. 清华大学：作为我国工科领域的领军学府，清华大学在自主招生方面也有着丰富的经验。学校根据专业需求，设定了一系列的自主招生考试和评估标准，以选拔符合其培养要求的学生。

3. 北京航空航天大学：北京航空航天大学在航空、航天等高科技领域有着很高的声誉。学校根据自身的发展需求，通过自主招生选拔具有相关专业潜力和兴趣的学生。

此外，北京市还有很多其他的学校，包括一些综合性大学和高职院校也都有自主招生的权限。这些学校根据自身的教学特点和需求，制定了一系列的选拔标准和程序，以选拔适合其培养要求的学生。随着教育改革的深入，越来越多的学校开始实行自主招生，给学生提供了更多的选择机会。