该大学附属中学有五个校区。

1、本部校区：位于北碚区文星湾杜家街43号，是西师附中的老校区，设有初中部、高中部和国际教育部。

2、水土校区：位于两江新区水土高新技术产业园云汉大道，也设有初中部、高中部和国际教育部。

3、两江校区：位于北碚区长平路666号，由东原集团与西师附中合作建设，只办理初中教育。

4、金州校区：位于两江新区金州大道，原为金州初级中学校，作为西师附中的初中分校。

5、大竹林校区：位于两江新区大竹林片区，原为竹林中学，作为西师附中的高中分校。