在CNMARC和MARC 21书目格式中，CALIS联合目录的自定义字段略有不同。

在CNMARC书目记录格式（中文编目采用）中，目前CALIS联合目录的自定义字段有：

091 统一书刊号

092 订购号

094 标准号

098 书商刊号

099 CALIS联合目录系统控制号

690 中国图书馆分类法分类号

692 中国科学院图书馆图书分类法分类号

694 中国人民大学图书馆分类法分类号

696 四库体系分类

920 馆藏信息

921 专项文献信息字段

998 书目记录所属成员馆代码

在MARC 21书目记录格式（外文编目采用）中，目前CALIS联合目录的自定义字段有：

093 中国图书馆分类法分类号

094 中国科学院图书馆图书分类法分类号

095 中国人民大学图书馆分类法分类号

096 杜威等其他分类号

098 书商刊号

099 CALIS联合目录系统控制号

920 馆藏信息

921 专项文献信息字段

998 书目记录所属成员馆代码