定向就业研究生与非定向就业研究生在就业方式、调取档案、培养费用以及奖助待遇等方面存在区别。

就业方式不同。定向就业研究生在入学前已确定工作单位，需签订定向协议才能入学，毕业后返回原单位。而非定向就业研究生录取时不确定工作单位，毕业时应服从国家就业指导，在国家规定的服务范围内进行安排或实行双向选择。

调取档案方面，定向就业研究生不调档案。毕业时学校不发派遣证或第三方协议，档案关系从哪里来回哪里。适合国家编制内的考生，无需放弃编制。而非定向就业研究生则需要调取档案，发派遣证。

培养费用方面，定向就业研究生分为定向就业和定向自筹。定向就业研究生在录取时已确定工作去向，与招生单位和定向单位签订定向就业合同书，定向培养费用由定向单位承担，无法享受助学金。定向自筹的培养费用一般由报考者自己承担，但部分单位可能有支持和报销政策。而非定向就业研究生的培养费用由报考者自己承担，在校期间可享受国家规定的奖学金和其他生活待遇。

奖助待遇上，定向就业研究生在校期间通常无法享受奖学金、助学金等。而非定向就业研究生在校期间能享受国家规定的奖学金和其他生活待遇。