集美大学在长期的办学过程中，形成了航海和水产两大专业领域的优势与特色。航海教育在我国高级航海人才的培养中占据重要地位，不仅在国内享有盛誉，在东南亚地区也颇具影响力，被公认为国内顶尖的航海院校之一。而水产学科同样在福建省具有较高的水平，并在国内享有一定优势与影响力。

轮机工程和水产养殖学两个学科更是被列为省级重点学科，其中轮机工程和机械设计制造及其自动化两个专业，更是被授予省级高等学校本科教育特色专业点。这些专业不仅在学术研究方面表现突出，在实际应用中也得到了广泛认可。

2007年12月，学校通过了教育部组织的本科教学工作水平评估，最终以优异的成绩顺利通过，这也充分展示了学校在教学质量和学术研究上的实力。

学校注重学科建设和人才培养，通过一系列的努力，不仅在航海和水产领域取得了显著成就，还在其他多个领域如土木工程、电子信息工程等方向上取得了卓越的成绩，为社会培养了大量优秀人才。

集美大学在专业建设方面，始终坚持理论与实践相结合的原则，注重培养学生的创新能力和实践技能，力求使学生不仅掌握扎实的专业知识，还能具备解决实际问题的能力。

学校还积极与国内外知名高校、研究机构及企业进行合作，为学生提供了丰富的实习实训机会，帮助他们更好地将所学知识应用于实际工作中。这些合作不仅为学生提供了宝贵的学习资源，也为学校赢得了良好的声誉。