山东省统计学会的最高决策机构是会员代表大会，其召开需有三分之二以上会员代表出席，决议需到会代表半数以上通过。每四年举行一次，特殊情况经常务理事会决议、业务主管单位审查和社团登记管理机关批准，最长延期不超过一年。会员代表由各会员单位和专业分会按名额推荐产生。

理事会作为会员代表大会的执行机构，由选举产生，理事任期四年，可连任。闭会期间，理事会负责领导学会日常工作，其会议须三分之二以上理事出席，决议需过半数通过。理事会通常每年召开两次会议，特殊情况可通过通讯形式召开。

常务理事会由理事会选举产生，对理事会负责，人数不超过理事的三分之一。常务理事会每年至少举行一次会议，其决策同样需三分之二以上常务理事同意方能生效。

学会设有秘书处，负责日常事务，由秘书长和副秘书长领导。会长、副会长和秘书长的任期为四年，特殊情况的任期延长需经常务理事会三分之二以上同意，报相关单位审批后执行。会长同时担任学会的法定代表人，不得同时担任其他社团的法定代表人。