制药工程是一个融合化学、药学（包括中药学）与工程学的工科专业。其主要培养目标是制造药品、研发新工艺、新设备、新品种，以及进行放大和设计相关人才。

这一专业名称的正式确认始于1998年，教育部在本科专业目录中将其纳入。开设制药工程专业的高校分为五类，包括理工类大学、综合性大学、医药类院校、高等专科学校，以及其它类型高校（如农学院、商学院等）。其中，理工类大学开设该专业的数量最多，其次是综合性大学，医药类院校紧随其后。在这类开设制药工程专业的高校中，约有30%设有药学院系，而设有工科院系的高校则占大多数，超过60%。