巴斯德时期微生物学家有以下几科：

1、细菌科学：这是微生物学的核心领域，主要研究细菌的形态特征、生长繁殖、代谢途径、遗传变异等方面的问题。

2、免疫学：这是微生物学的重要分支，主要研究生物体对抗微生物侵袭的机制和方法，包括先天免疫和获得性免疫两个方面。

3、病原微生物学：这是微生物学的应用领域，主要研究各种病原微生物的致病机理、传播途径、防治方法等方面的问题。

4、发酵技术学：这是微生物学的工业应用领域，主要研究利用微生物进行发酵生产的技术和方法。

5、环境微生物学：这是微生物学的环境应用领域，主要研究微生物在环境中的分布、演化、生态功能等方面的问题。