追溯至1906年，学校源自川东师范学堂的建立。1936年，其名称变为四川省立教育学院。

1950年，四川省立教育学院与国立女子师范学院合并，成立了西南师范学院；同期，农艺、园艺和农产制造等系与1946年创办的私立相辉学院等合并，组建了西南农学院。

1985年，两所学院分别更名为西南师范大学和西南农业大学。

2000年，重庆市轻工业职业大学并入西南师范大学。随后的2001年，西南农业大学、四川畜牧兽医学院、中国农业科学院柑桔研究所合并，组成了新的西南农业大学。

2005年，西南师范大学与西南农业大学合并，共同构建了现在的西南大学。