济宁有济宁医学院、曲阜师范大学、济宁学院等6所大学。

1、济宁医学院，简称“济医”，是由山东省人民政府举办的高等医学院校，入选国家首批卓越医生教育培养计划、山东省卓越工程师教育培养计划、山东省应用型本科高校建设首批支持单位、山东省法学院校法治人才培训基地，是精神医学专业本科国内办学最早、招生规模最大的高等院校。

2、曲阜师范大学，简称曲阜师大，位于山东省曲阜市，由山东省教育厅与济宁市人民政府共建，是全国首批招收研究生高校、山东省重点大学、山东省一流学科建设高校、推荐免试攻读硕士研究生高校、教育部实施卓越中学教师培养高校、教育部师德师风建设基地。

3、济宁学院位于山东省济宁市，是中华人民共和国教育部批准设立的一所省属全日制普通本科高等学校。