项目组酬金和校内酬金的区别是分发主体不一样。根据查询相关资料得知，校内酬金指除一次工资和一次奖助学金之外的其他各项酬金业务，包括教职工的各种绩效、津补贴、劳务、奖金和学生的各种奖学金、助学金、补贴补助和劳务等。项目组酬金是自己参加项目，与外部公司合作或自己团队获得的酬金。