沈阳药科大学提供多种专业选择，包括药学、药物制剂、药物分析、国家理科基础药学基地班（八年制本硕博连读）、药学（日语强化班，五年制）、药学（英语强化班，五年制）、制药工程、环境科学、应用化学、药物化学、中药学、中药资源与开发、药学（食品药学）、中药制药、葡萄与葡萄酒工程、中药学（日语强化班，五年制）、生物工程、临床药学（五年制）、生物技术制药、生命科学与技术基地班（六年制本硕连读；前两年半在吉林大学进行基础科目学习，第六学期回该校进行研究生课程学习）、工商管理、市场营销、国际贸易与经济、药事管理、生物医学工程。

药学专业被认为是该校最佳选择，尤其基地班和强化班更为人所青睐。药物制剂、中药学、药物分析、药物化学和生物技术制药也是特色专业，这些专业的录取分数线通常较高。

药学专业的学生可以深入学习药物研发、药理学、药剂学等相关知识，具备较强的科研能力和实践操作技能。药物制剂专业的学生专注于药物制剂技术的研究与应用，培养了学生在药物制剂领域的专业知识和技能。中药学专业的学生则学习中药的理论知识与实际应用，培养了学生在中药领域的专业知识和技能。药物分析专业的学生学习药物分析方法和技术，培养了学生在药物分析领域的专业知识和技能。药物化学专业的学生学习药物化学的理论知识与实际应用，培养了学生在药物化学领域的专业知识和技能。生物技术制药专业的学生则学习生物技术制药的理论知识与实际应用，培养了学生在生物技术制药领域的专业知识和技能。

总体而言，沈阳药科大学的专业设置全面，涵盖了药物研究与开发、药物制剂、中药学、药物分析、药物化学、生物技术制药等多个领域，为学生提供了丰富多样的学术探索与职业发展的机会。