江西农业大学王牌专业涵盖农学、林学、动物科学、动物医学、土地资源管理、食品科学与工程、生物工程、园艺、农业资源与环境、园林、农林经济管理、农业机械化及其自动化、林产化工等多个领域。

学校特色专业中有国家二类特色专业动物科学，以及国家一类特色专业农学、农林经济管理、生物工程。

另外，江西农业大学还设有省级特色专业食品科学与工程、园林、软件工程、动物医学、园艺、农业机械化及其自动化、土地资源管理、生物技术、英语等课程。