清华大学环境生物技术实验室的研究主要集中在多个前沿领域，致力于提升生物催化过程的效率和理解。首先，他们开发了快速可视化定量解析方法，结合融合蛋白技术，深入探究生物催化过程的动态机制。

其次，实验室关注多功能微生物体系的优化，通过快速定量解析技术，探寻微生物在不同环境下的最佳性能，以实现高效资源利用和环境保护。

他们还聚焦于辅酶再生体系的构建，该体系在生物氧化还原反应中发挥关键作用，为绿色化学提供新的解决方案。新型氢酶的功能解析与应用研究也占据一席之地，探索其在能源转换中的潜力。

细胞膜工程和电子传递过程的控制技术，是实验室研究的另一个重点，旨在提高生物系统的效率和稳定性。在基因工程方面，他们致力于甲烷氧化菌的改造与代谢途径重构，为环保和能源生产提供技术支持。

实验室还合作进行肝素酶的高效表达和清洁制备，开发出低分子量肝素，这对生物制药和环保领域具有重要意义。发酵生物制氢的代谢工程和生物过程工程也是研究热点，旨在通过生物途径实现可持续的氢能源生产。

系统生物工程在蓝色素生产菌种的选育和优化方面也发挥着重要作用。与工物系李和平博士的合作，他们研究了ARTP诱变系统对工业微生物育种的影响，推动了生物技术在工业领域的应用。

甲烷氧化菌的高效培养及其应用技术研究，为解决能源问题提供了实用策略。同时，剩余污泥处理方面，实验室探索了厌氧-好氧耦合废水生物处理技术，以实现废物资源化利用。

微米气泡技术在环境和工业生物技术中的应用，展现了其在提升处理效率和降低环境污染中的巨大潜力。总的来说，清华大学环境生物技术实验室的科研工作涵盖了生物催化、微生物工程、基因改造等多个维度，为环保和可持续发展做出了重要贡献。