重庆交通大学以其多个优质专业而闻名，其中包括土木工程、港口航道与海岸工程、水利水电工程、工程管理、工程造价、会计学、建筑学以及给水排水工程和船舶与海洋工程等。

学校的本科专业总数为42个，涵盖了5大学科门类。其中，土木工程、港口航道与近海工程、交通运输工程和工程管理等4个专业被认定为重庆市的品牌专业。

此外，重庆交通大学还拥有多个重点学科，包括桥梁与隧道工程、道路与铁道工程、港口、航道与近海工程以及管理科学与工程等，这些都是“十一五”期间的重点建设学科。同时，还有工程力学、材料学和载运工具运用工程等学科被列为“十一五”期间的立项建设重点学科。

这些学科和专业的设置，不仅体现了重庆交通大学在交通土建领域的深厚实力，也展示了其在工程管理、给水排水等领域的广泛布局。学校通过不断优化专业结构，努力提升教学质量，以培养更多具备实践能力和创新精神的优秀人才。

重庆交通大学在多个领域内的专业设置和学科建设，使其成为了一所综合性较强的高等学府，不仅为学生提供了丰富的学习资源，也为社会输送了大量高素质的专业人才。