上海市的20所二本大学在2018年的理科排名中，上海海关学院拔得头筹，上海金融学院紧随其后，上海中医药大学位列第三。以下是2018年上海二本大学排名理科的具体榜单，此排名是根据当年理科二本录取平均分得出的，涵盖了部分专业在二本招生的一本大学。

2018上海二本大学排名理科

1. 上海海关学院，本科二批

2. 上海金融学院，本科二批

3. 上海中医药大学，本科二批

4. 上海立信会计学院，本科二批

5. 上海商学院，本科二批

6. 上海工程技术大学，本科二批

7. 上海政法学院，本科二批

8. 上海第二工业大学，本科二批

9. 上海电力学院，本科二批

10. 上海海洋大学，本科二批

11. 上海体育学院，本科二批

12. 上海应用技术大学，本科二批

13. 上海视觉艺术学院，本科二批

14. 上海电机学院，本科二批

15. 上海健康医学院，本科二批

16. 上海外国语大学贤达经济人文学院，本科二批

17. 上海师范大学天华学院，本科二批

18. 上海杉达学院，本科二批

19. 上海建桥学院，本科二批

20. 上海兴伟学院，本科二批