福建艺术职业学院的教育机构分布广泛，拥有六个主要的教学实施部门，包括音乐系、舞蹈系、美术系、社会文化系、戏剧系以及基础教学部。学院为学生们提供了丰富的艺术类专业课程，涵盖了音乐（包括器乐演奏和声乐表演）、艺术设计（美术专业）、舞蹈表演、文化事业管理、群众文化艺术、戏曲表演、南音、木偶艺术、茶文化艺术、杂技以及曲艺等多个领域。

在学历层次上，学院提供了多样化的选择。有针对高中、中专、职高起点的三年制专科教育，初中起点的五年制高职，以及初中起点的三年制中专。此外，还有针对小学起点音乐与舞蹈方向的六年制中专以及成人大专，旨在满足不同起点学生的学习需求。这种多元化的教育体系确保了学校教育的全面性和连续性，无论是横向的学校教育还是纵向的教学层次，都实现了无缝衔接和逐步递进，形成了一个完整的艺术教育网络。