山西医科大学拥有多项国家级和省级重点学科，为医学教育和科研提供了坚实的基础。在国家级学科方面，生理学被列为国家重点学科，而重症医学、泌尿外科学、中医护理学、骨科学、肾病学、普通外科学、老年病学、急诊医学、风湿免疫学、护理学、病理学、眼科学和心血管内科则被列为国家临床重点专科。这些学科在各自领域内具有较高的学术地位和影响力。

在省级层面，生物学被列为山西省优势重点学科，公共卫生与预防医学、临床医学和护理学则被列为山西省特色重点学科。此外，基础医学被列为山西省“1331工程”优势特色学科，显示出其在医学科研领域的领先地位。

在专业建设方面，临床医学、预防医学、法医学、药学、护理学等五个专业被列为国家级特色专业建设点，体现了学校在医学教育方面的优势。同时，临床医学专业也被纳入国家卓越医生教育培养计划，旨在培养具有卓越医疗技能和创新能力的医学人才。

在省级品牌专业中，临床医学、预防医学、法医学、口腔医学、药学和医学影像学六个专业被列为省级品牌专业，展示了学校在医学教育方面的全面性和多样性。而在省级特色专业方面，口腔医学、药物制剂、麻醉学、医学影像学、公共事业管理（卫生事业管理方向）和中药学六个专业被列为省级特色专业，进一步丰富了学校的学科体系。

此外，临床医学、预防医学、护理学、法医学和药学五个专业被列为省级优势特色专业，彰显了学校在这些领域的卓越成就。