江苏航运职业技术学院的专业设置涵盖了航海、轮机、船舶、港口、物流、会计、电子商务等多个领域。其中，航海技术专业旨在培养具备现代航海技术和管理能力的高素质技术技能人才。轮机工程技术专业则专注于培养能够从事船舶动力装置管理和维护的高级工程技术人才。船舶电子电气技术专业致力于培养能够在船舶电子设备领域从事设计、安装、调试和维修工作的技术人才。船舶工程技术专业则注重培养能够进行船舶设计、制造和管理的复合型人才。

海洋工程技术专业旨在培养具备海洋资源开发和海洋工程管理能力的技术人才。焊接技术与自动化专业则专注于培养能够在焊接领域进行自动化操作和管理的技术人员。港口与航道工程技术专业致力于培养能够在港口与航道建设及维护方面发挥重要作用的专业人才。建筑工程技术专业旨在培养具备建筑工程施工、设计和管理能力的技术技能人才。工程造价专业则注重培养能够在工程项目造价管理方面发挥作用的技术人才。

港口与航运管理专业旨在培养具备港口与航运管理能力的专业人才，能够应对港口与航运领域的复杂挑战。报关与国际货运专业则专注于培养能够在国际贸易领域从事报关和国际货运工作的技术人才。物流管理专业旨在培养具备现代物流管理能力的专业人才，能够应对现代物流领域的发展需求。会计专业则注重培养具备会计核算、财务管理能力的技术人才。

电子商务专业则致力于培养能够在电子商务领域从事网络营销、网站开发和管理工作的技术人才。城轨交通运营与管理专业旨在培养具备城市轨道交通运营管理能力的专业人才，能够应对城市轨道交通领域的发展需求。