学校拥有1个一级学科国家重点学科（水利工程）。其中水利工程、土木工程两学科综合实力处于全国领先位置，尤其是水利工程学科总体实力最强，支撑及相关学科门类较多，水利及支撑学科人才梯队的综合实力处于国内一流地位。在世界水文与水资源工程方面仅次于荷兰代尔夫特理工大学，处于世界领先水平。

其次还有环境工程，工程管理，港航，工商管理，土木交通，地质等强势专业。