国家卫生健康委于2022年7月29日发布通知，决定在北京市、上海市、湖南省设置国家精神疾病医学中心，形成南北协同、优势互补的模式，以带动全国精神疾病领域建设与发展。北京市的国家精神疾病医学中心由北京大学第六医院和首都医科大学附属北京安定医院联合主体设置；上海市、湖南省的国家精神疾病医学中心则分别以上海市精神卫生中心、中南大学湘雅二医院为主体设置。

2022年11月20日，国家精神疾病医学中心在北京大学第六医院揭牌，标志着医学中心正式启动。11月25日，医学中心在上海市精神卫生中心启动。目前，中南大学湘雅二医院的国家精神疾病医学中心启动仪式已定于2023年4月21日举行。

北京大学第六医院院长陆林强调，作为国家精神疾病医学中心的牵头医院，将重点规划国家示范级精神科师资能力培训中心、多点辐射精神科网络在线远程教育中心，协助制定国家级精神科专科培训标准，同时加强国家精神医学分级诊疗服务网络和管理运行机制建设。

上海市精神卫生中心在2022年11月25日举办的国家精神疾病医学中心启动仪式暨东方精神医学论坛上，与上海申康医院发展中心、上海交通大学、上海市卫生健康委员会、中国工程院、上海市人民政府参事等共同启动医学中心。院长赵敏表示，成为国家精神疾病医学中心，不仅是荣誉，更是沉甸甸的责任，将推动医院实现跨越发展。

中南大学湘雅二医院的国家精神疾病医学中心定位于引领综合医院精神科发展，与精神专科医院国家中心合作，推进中国精神卫生服务高效、高质量发展。中心将向上承接国家实验室基础研究最新成果，实施转化研究，向下与省、市、县三级精神卫生机构、社区合作实施成果推广应用，重点覆盖中西部和南部包括大湾区，辐射“一带一路”沿线发展中国家。