江宁大学城内的南京医科大学江宁校区位于江宁大学城东北部，背靠东山镇，东侧邻近宁杭高速公路和高速铁路，北侧有天元路，西侧则是60米景观大道。

周围交通便利，附近设有宁杭高速和绕越公路出口，地铁一号南延线的出口也近在咫尺，江宁长途汽车站也位于此地，距离南京火车南站约10公里。

南京医科大学作为首批教育部、国家卫生和计划生育委员会、江苏省共建高校，同时也是江苏高水平大学建设高校，还被选为教育部卓越医生教育培养计划试点高校和国家建设高水平大学公派研究生项目实施高校。

此外，南京医科大学还是国家特色重点学科项目建设高校，并且是长三角医学教育联盟的创始成员之一。学校历史可追溯到江苏省立医政学院，1957年由镇江迁至南京，更名为南京医学院。

1962年，该校被列为全国首批六年制医药院校，1981年成为全国首批博士、硕士学位授予单位。直至1993年，学校正式更名为南京医科大学。

2015年9月，南京医科大学获批成为教育部、国家卫生计生委与省政府共建医学院校。