在暨南大学的汉语方言研究中心，设有多个专门的研究室，以推动方言研究的深入。其中，岭南方言研究室由甘于恩主任（兼）领导，专注于岭南地区的方言研究。

另一个重要的部门是海外汉语方言研究室，由陈晓锦主任主持，致力于探索和理解汉语在国际间的变体和传播。

在技术手段与研究方法上，语言研究技术处理室由刘新中主任引领，利用先进的技术手段提升研究的效率和精度。

此外，中心还设立了多个工作站，以加强与地方教育机构的合作。在2010年6月29日，暨南大学汉语方言研究中心与肇庆学院合作建立了教学科研工作站；9月18日，与罗定职业技术学院建立了科研工作站；10月14日，深圳大学的教学科研工作站也随之成立；而早在同年12月5日，肇庆学院的教学科研工作站就宣告成立。