厦门海洋职业技术学院提供了多种专业的教育选择，涵盖水产养殖、航海、航运等多个领域。具体来说，水产养殖技术专业分为理工和文史两个方向，分别针对理工科和文科背景的学生。航海技术专业也分为理工和文史两个方向，旨在培养具备专业知识和技能的航海人才。

国际航运业务管理专业则专注于培养国际航运业务的管理人才，同样设有理工和文史两个方向。轮机工程技术专业同样提供理工和文史两个方向的选择，旨在培养具备轮机工程专业知识和技能的技术人才。

船舶检验专业则专注于培养具备船舶检验专业知识和技术的人才。港口业务管理、报关与国际货运、制冷与冷藏技术、数控技术、模具设计与制造、机电一体化技术、计算机信息管理、图形图像制作、电子信息工程技术、光电子技术、通信技术、水环境监测与保护、食品加工技术、食品营养与检测、食品加工及管理、国际金融、国际商务、电子商务、物流管理、旅游管理、商检技术、商务英语等专业也均设有理工和文史两个方向，旨在培养具备相关领域专业知识和技能的技术人才。

学校还特别为商务英语、商务日语专业的学生提供了单独考试的机会，以便更好地满足学生的学习需求。