天津医科大学拥有多个学院，包括基础医学院、研究生院、公共卫生学院、口腔医学院、药学院、护理学院、继续教育学院以及临床医学院。临床医学院下设第一临床医学院和第二临床医学院，还有中西医结合国际学院。除此之外，学院还包含多个系部，例如医学检验学系、医学影像学系、生物医学工程系、医学人文科学系、外语教学部、实验动物科学部和社科部等。

基础医学院致力于基础医学的教学与研究，研究生院则专注于研究生教育与培养，公共卫生学院则侧重于公共卫生领域的研究与实践。口腔医学院、药学院和护理学院分别专注于口腔医学、药物科学和护理学的专业教育与研究。继续教育学院则为在职人员提供继续教育的机会。临床医学院负责临床教学与实践，第一临床医学院和第二临床医学院分别负责不同的临床教学任务。中西医结合国际学院则致力于中西医结合医学的研究与国际交流。

医学检验学系主要负责医学检验技术的教学与研究，医学影像学系专注于医学影像诊断与技术的发展，生物医学工程系则侧重于生物医学工程的应用与创新。医学人文科学系致力于医学人文精神的培养与研究，外语教学部提供多语种教学支持，实验动物科学部负责实验动物的管理和研究，社科部则专注于社会科学研究。