商洛的高等教育以商洛学院和商洛职业技术学院为代表，其中商洛学院在商洛大学排名中位列第一。商洛学院，简称“商大”，作为一所全日制普通本科院校，坐落于陕西省商洛市。学校的历史源远流长，其前身可以追溯至1976年成立的陕西省商洛地区五七师范学院，此后经历多次更名与合并，最终在2006年获得教育部批准，成功升格为本科院校。2011年，商洛学院成为省市共建高校，2014年被列入陕西省首批转型发展试点高校。近年来，学校更是入选了全国百所产教融合发展工程应用型高校，并于2018年被确定为陕西省“一流学院”建设单位。在学术领域，商洛学院与多家国内高校建立了对口支援与合作办学友好关系，包括西安交通大学、陕西师范大学、西北大学、浙江万里学院等。

商洛职业技术学院作为商洛的另一所高等职业院校，同样值得关注。它由陕西省人民政府批准，教育部备案，是一所全日制公办普通高等职业院校。学院的前身是创建于1960年的商洛市卫生学校，经过数十年的积淀与整合，于2005年在原商洛卫生学校和商洛师范学校的基础上组建成立。学院位于商洛市商州区丹南新区，设有商洛市职教培训中心，实行“两块牌子、一套人马”的管理模式。