三明学院王牌专业包括机械设计制造及其自动化、网络工程、土木工程、化学工程与工艺等。此外，学校还有以下特色专业和一流本科专业建设点：

一流本科专业建设点包括：旅游管理与服务教育（国家级、省级），传播学、生物技术、电子信息工程、物联网工程（省级），数学与应用数学、车辆工程、环境工程、动画（省级）。

国家级特色专业有艺术设计（第六批）。

卓越工程师教育培养计划专业为化学工程与工艺。

学院开设本科专业如下：

经济与管理学院：财务管理、市场营销、电子商务、物流管理、旅游管理与服务教育、贸易经济。

艺术设计学院：美术学、环境设计、视觉传达设计、服装与服饰设计、动画、产品设计、数字媒体技术。

信息工程学院：数学与应用数学、网络工程、物联网工程、通信工程、计算机科学与技术、人工智能。

机电工程学院：物理学、光电信息科学与工程、电子科学与技术、电子信息工程、机械设计制造及其自动化、车辆工程、工业设计、机器人工程。

资源与化工学院：化学、材料化学、化学工程与工艺、生物技术、环境工程、资源环境科学。

建筑工程学院：土木工程、风景园林、工程造价。

海峡理工学院：财务管理、土木工程、市场营销、视觉传达设计、环境设计、动画。

文化传播学院：汉语言文学、传播学、播音与主持艺术。

海外学院（外国语学院）：英语、商务英语、财务管理（国际会计方向）、土木工程。

体育与康养学院：体育教育、社会体育指导与管理。

教育与音乐学院：小学教育、学前教育、音乐学。