该校研究生学费一年为两万至五十几万元每年。

计算机科学技术学院全日制电子信息专业学位硕士研究生的学费为8万元，分三年缴纳，每年约为2.67万元。

留学生全日制电子信息专业学位硕士研究生的学费同样为8万元，分三年缴纳，每年约为2.67万元。

复旦MBA项目（非全日制）的学费为53.98万元，分两年半缴纳。