比较南通大学与徐州医科大学，从大学排名角度看，南通大学更占优势。根据软科中国大学排行榜，南通大学在2022年的全国排名为169名，而徐州医科大学的排名为223名，南通大学的排名明显优于徐州医科大学。若对比两校的排名变化趋势，可以看到南通大学的排名从2021年的164名下滑至2022年的169名，排名虽有轻微下滑，但整体而言，南通大学的学术影响力和声誉仍优于徐州医科大学。

综上所述，南通大学与徐州医科大学在学术排名上存在显著差异，南通大学的学术地位和排名相对较高。在2022年的软科排行榜中，南通大学的排名较徐州医科大学高出54位，反映出其在教育资源、学术成果等方面具有更大的影响力。在选择这两所医学院校时，考虑到排名和学术声誉因素，南通大学无疑是更好的选择。