南航与南理工两所高校排名相近，南航在全国大学排名、江苏省高校排名中位于第33名，南理工则位于第38名。校友会最新排名中，南航位列第57名，南理工则在第50名。

在2022年第四轮学科评估中，南航有3个学科被评为A档，包括力学、机械工程、管理科学与工程，以及5个被评为B+学科的电气工程、控制科学与工程、计算机科学与技术、航空宇航科学与技术、软件工程。南理工则有2个学科进入A档，分别是兵器科学与技术的A+学科和化学工程与技术的A-学科，此外还有4个学科被评为B+，即机械工程、光学工程、控制科学与工程、计算机科学与技术。

2018年，南航本科生就业率达到了98.54%，硕士生就业率更是高达99.58%；南理工的相应数据分别为98.54%和98.96%，两者相差不大。

两所高校在2018年对各省的录取分数对比显示，南航在北京、山西、吉林等地的理科录取最低分略高于南理工，但差距并不大。综合来看，南航与南理工的综合实力不分上下，学科评估结果接近，毕业生就业率也相差无几。南航在名气方面略占优势，这一点上稍胜一筹。