系统工程和模式识别与智能系统这两个二级学科偏向于软件和算法，被认为是比较适合软件开发的专业方向。而控制理论与控制工程则在东南大学的五个二级学科中显得最为稳定，也是招生人数最多的学科之一。这个方向就业前景也不错，适合那些对软件开发感兴趣的同学。

对于想要从事软件开发的同学，可以选择系统工程或模式识别与智能系统这两个方向，这两个方向在软件和算法方面有较深的研究，可以为将来从事软件开发打下坚实的基础。而如果更倾向于硬件开发，那么控制理论与控制工程则是一个不错的选择。控制理论与控制工程不仅涉及到软件开发，还涉及硬件设计和实现，适合那些希望在硬件开发方面有所作为的同学。

此外，如果对航空领域感兴趣，尤其是导航、制导与控制方面，可以选择控制理论与控制工程。这个方向的研究内容涵盖了理论与实践，既包括理论研究，又涉及实际应用，适合那些希望深入研究该领域并最终取得博士学位的同学。

总的来说，东南大学的控制理论与控制工程专业在就业方面表现稳定，适合那些对硬件开发、航空领域感兴趣的同学。这个专业不仅培养了学生的理论知识，还注重实际应用，为学生提供了广阔的职业发展空间。