山东大学自动化类包含四个本科专业：自动化、测控技术与仪器、生物医学工程、物流工程。

自动化专业是国家级特色专业，山东省品牌专业，并通过了国家工程教育专业认证。生物医学工程专业则是山东省品牌专业。

山东大学控制科学与工程学院提供“控制科学与工程”、“生物医学工程”两个一级学科博士学位授予权与博士后流动站，同时拥有7个二级学科博士学位授予权和9个硕士学位授予权。