在研究生入学考试的领域中，306西医综合和699科目是两种截然不同的专业科目。它们之间的区别不仅体现在考试内容和形式上，还涉及考试的组织和评分标准。

首先，306西医综合科目是国家统一大纲，全国统一命题，所有考生面对的是同一份试卷，其性质与政治考试相似，都是全国统考。而699科目则是由各学校自行命题，每所学校的考试大纲和内容都可能有所不同，因此，考生面临的试卷也会有所差异。

其次，临床考试内容方面，306西医综合侧重于内科和外科的临床知识，而699临床考试内容则包括诊断学和外科学总论，两者在内容上存在明显的区别。

再者，从考试时间的变迁来看，306西医综合科目曾是2016年及之前的研究生入学考试（西医）必考科目，早在2007年以前，该科目满分设定为150分。然而，从2007年起，满分调整为300分，并且题目数量增加至180道，体现了考试难度的提升。