规培生与不规培生在培训方式、证书认证机构及选拔过程存在显著区别。

规培生接受由全国或地方医学会或卫生部门统一组织的培训，内容、标准和考试要求均明确，毕业后获得国家或地方认可的医师资格证书或职业资格证书。相反，不规培生的培训机构、学习内容、标准和考试要求未有规定，毕业后仅获得该机构颁发的证明。

规培生通常通过当地卫生部门组织的医疗机构选拔招生，参与竞争性招生过程。而不规培生则以个人或家庭自费报名参加培训，无需通过选拔。

完成规培学业后，规培生必须在指定医疗机构实习和进修一段时间，方能获得医师资格证书。相比之下，不规培生不受此限制。