两个大学都是211工程重点大学，但是两个大学擅长的学科不一样，所以不能一概而论哪个好，得看你想学啥子专业。

福州大学的优势学科：化学、土木工程、化学工程与技术、管理科学与工程、机械工程、材料科学与工程、电气工程、电子科学与技术、工商管理等；

哈工程的优势学科：核科学与技术、船舶与海洋工程、计算机科学与技术、信息与通信工程、控制科学与工程、软件工程、机械工程、力学、光学工程、动力工程及工程热物理、材料科学与工程、管理科学与工程等；

综合实力来讲哈工程要比福州大学更强一些