东南大学有三个校区，分别是九龙湖、四牌楼和丁家桥。其中，九龙湖校区位于南京市江宁区，是东南大学的主校区，也是新校区，环境优美，建筑风格现代化。四牌楼校区位于南京市中心，有很多民国建筑和梧桐树，气氛非常好。丁家桥校区位于南京市江宁区，是东南大学的老校区之一。

关于文化氛围，东南大学注重文化建设，梳理学校景观文化，按照学校历史文脉，组织做好学校建筑文化、历史文化、革命文化的挖掘整理工作。此外，东南大学还开展校园景观系列评选活动，完善网上地图导览功能，开发校区导览手机APP等应用。