南通大学杏林学院设立奖学金和助学金，帮助优秀学生与经济困难生。

奖学金包含优秀学生奖学金和单项奖学金，覆盖学生比例为40%，对研究、创新、文体活动、社会工作等方面有突出表现者给予单项奖学金奖励。国家奖学金8000元/生•年，国家励志奖学金5000元/生•年，助学金人均3000元/年面向贫困生。

学院实施困难生资助办法，提供国家奖学金、国家励志奖学金、助学金，还配套助学贷款、临时困难补助、各类专项补助、勤工助学、社会助学金等措施，帮助经济困难学生顺利完成学业。

国家助学金评定办法要求，学生需是贫困生才能申请。申请需填写学校提供的申请表，回执家长相关证明，并通过学校审批。贫困程度决定助学金等级，建议学生真实反映情况。成绩优异是获得助学金的重要条件，学生需保持成绩良好。