南京工业大学拥有28个二级学院，涵盖了广泛的学科领域。学校设有11个学部，这些学部和学院共同培养了超过3.8万名学生。

在学科建设方面，南京工业大学表现出色。它拥有一级重点学科1个，国家重点学科培育建设点共3个，其中一级学科国家重点学科培育建设点1个，江苏高校国家重点学科培育建设点2个。此外，学校还获得了16项江苏高校优势学科项目的资助，包括4项一期项目、6项二期项目和6项三期项目。

南京工业大学的学科建设得到了政府的高度重视和支持。学校还拥有2个“十三五”江苏省重点学科和8个“十四五”江苏省重点学科。博士后科研流动站和博士、硕士学位授予点的数量也非常丰富。具体来说，学校设有7个博士后科研流动站，8个一级学科博士学位授予点，10个自主设置的二级学科博士学位授予点，1个博士专业学位授予点，29个一级学科硕士学位授予点，20个自主设置的二级学科硕士学位授予点，以及18个硕士专业学位授予点。

在专业设置方面，南京工业大学非常多样化，提供了101个本科专业，这些专业覆盖了工、理、管、经、文、法、医、艺、教9个学科门类。这为学生提供了广泛的选择，有助于他们根据自己的兴趣和职业规划进行选择。