截至2022年3月，华南农业大学设有25个学院（部），提供101个本科专业。农学院专注于农学和种子科学与工程；植物保护学院则侧重于植物保护；林学与风景园林学院开设了林学、风景园林、园林、森林保护、城乡规划、旅游管理、草业科学、中药资源与开发和野生动物与自然保护区管理等专业；园艺学院则涵盖了园艺、设施农业科学与工程和茶学；兽医学院则专注于动物医学和动物药学。

除此之外，华南农业大学还设有其他多个学院，如生命科学学院，主要涉及生物技术、生物科学、生物制药等专业；环境科学与工程学院，涵盖环境科学、环境工程、环境生态工程、环境设计等专业；食品科学与工程学院，提供食品科学与工程、食品质量与安全、食品营养与健康等专业；信息学院，专注于计算机科学与技术、软件工程、网络工程、信息安全等专业；经济管理学院，开设经济学、管理学、市场营销、会计学、财务管理等专业；机械与汽车工程学院，涵盖机械设计制造及其自动化、汽车服务工程、工业工程等专业；土木与交通工程学院，提供土木工程、交通工程、道路桥梁与渡河工程等专业；理学院，涉及物理学、化学、应用化学、数学与应用数学等专业；人文与法学学院，涵盖汉语言文学、法学、社会工作等专业；外国语学院，开设英语、日语、德语等专业；艺术学院，提供视觉传达设计、环境设计、音乐学等专业；信息与教育技术中心，主要负责学校信息技术支持与教育技术研究。

此外，华南农业大学还设有多个研究机构，如动物科学学院、资源环境学院、食品科学与工程学院、经济管理学院、信息学院、机电工程学院、土木与交通工程学院、理学院、人文与法学学院、外国语学院、艺术学院等，涵盖多个领域，为学生提供了丰富的学习和发展机会。