这种情况建议不用犹豫了。直接去上海交大。

其实从你说的情况分析，好几项都很明显地在向上海交大倾斜：

1 能够报送交大，这么好的机会人家可是想得都未必能得到，要珍惜哦；

2 你女友去了交大，南京上海之间肯定会让你们发生距离感，长此以往很危险的会。你若是珍惜和她的感情，就应该自己做出选择和调整，这一点谈不上丝毫的牺牲哦，从南大去交大对你人生来说也是走上坡路；

3 你不想读博，那么摆在你眼前的就是两年后的求职就业，上海的就业市场明显比南京更大，高薪机会更多，再凭借交大的牌子和自身实力，不愁成为职场金领；

4 研究生都是要跟导师的，南大有导师愿意，这种条件不算什么，到了交大也会有出色的导师收你；

综上所述，能读名校跟随名师、能和女友在一起，又能在上海提前为更好的就业作准备，还愁什么呢？