电气工程及其自动化本科毕业生，可申请考取以下三个方向的研究生专业：

首先，如选择控制方向的专业，例如：控制理论与控制工程、控制仪器与自动化装置、导航制导与控制，其初试科目为自动控制原理，复试则涉及微机原理及应用。

其次，若意向于电气方向的专业，初试科目则为电路原理，复试时可根据个人兴趣选择电力电子技术或电机与拖动进行深入学习。

最后，对于电子科学方向的申请，初试可能会涉及数字电路或信号与系统，复试阶段则可能涵盖电磁场与电磁波或电子线路等专业知识。