首都医科大学重点学科涵盖多个领域，包括但不限于外科学（神经外科）、眼科学、耳鼻咽喉科学、心血管病学、儿科学、神经病学、消化系病学、影像医学与核医学、中西医结合基础、中医眼科学等。学校还设有培育学科，如国家中医药管理局重点学科的中西医结合基础、中医眼科学、中医心病学等。学校在生物医学工程领域也有北京市重点一级学科。全科医学学科则是北京市交叉学科重点学科。在北京市重点二级学科中，口腔基础医学、口腔临床医学、药物化学、药理学、社会医学与卫生事业管理等学科也占据重要位置。北京市重点建设的一级学科中，中医学是关键学科之一。建设二级学科包括应用心理学、中西医结合基础、中西医结合临床、药剂学、药物分析学等。北京高校高精尖学科中，口腔医学、临床医学、基础医学等是学校的优势学科。

首都医科大学，作为北京市重点高等院校，隶属于北京市人民政府、国家卫生健康委员会、教育部共建，是国家首批“卓越医生教育培养计划”试点高校之一。学校历史悠久，成立于1960年，前身为北京第二医学院，后更名为首都医学院，于1994年正式定名为首都医科大学。学校于1985年被确定为北京市重点院校，1986年再次更名，并在2001年2月12日，通过整合北京联合大学中医药学院、北京医学高等专科学校和北京职工医学院，进一步扩大了其规模和影响力。学校在医学教育领域内享有盛誉，是培养高水平医学人才的重要基地。