南理工的计算机科学与技术学院设有多个系和研究机构，涵盖了广泛的计算机领域。从计算机科学与技术系到智能机器人研究所，学院的科研实力不容小觑。此外，南理工的“高维信息智能感知与系统”教育部重点实验室以及江苏省公安厅社会公共安全重点实验室也表明了其在特定领域的强大研究能力。

相比之下，南航计算机科学与技术学院在计算机应用和模式识别与智能系统方面有着深厚的积淀。学院的历史可以追溯到1959年，当时设立了“解算装置”专业，是全国最早设立的计算机专业之一。近年来，南航计算机学院获得了多个国家级和省级重点学科的支持，如“模式识别与智能系统”和“计算机科学与技术”。此外，学院还拥有多个博士后流动站和硕士点，形成了完整的培养体系。

南邮计算机学院则更专注于信息安全领域，拥有信息安全博士点以及计算机科学与技术、计算机系统结构、计算机应用技术、计算机软件与理论等硕士点。学院设有信息安全、计算机科学与技术和软件工程三个本科专业，提供从本科到博士的多层次教育。

从综合来看，南理工在计算机科学与技术的整体水平上具有优势，南航在模式识别与智能系统方向有突出贡献，而南邮则在信息安全领域领先。选择哪个方向，还需根据个人兴趣和职业规划来决定。