各试点院校会计硕士设置的专业培养方向各不相同，主要包括财务会计理论与实务（CFO）、审计理论与实务（CPA）、成本管理与实务、舞弊审计与法务会计等。

课程大致分为公共课、必修课（核心课）和选修课（方向课）等。其中，公共课包括社会主义市场经济理论与实践、英语、管理经济学等；必修课包括高级财务会计理论与实务、高级财务管理理论与实务、高级审计理论与实务、高级管理会计理论与实务、商业伦理与会计职业道德、国际会计准则专题、政府与非营利组织会计、财务报表分析、业绩评价与激励机制、国际审计准则专题、会计师事务所管理、内部控制理论与实务等；选修课包括数量分析方法，金融市场与金融工具，市场营销管理，企业并购，技术经济与管理，投资学，公共财政与国有资产管理，战略管理和经济法等。

按全日制MPAcc教学要求，不会如普通硕士那样全理论。要求实践性课程不少于半年。鼓励案例教学方法，开展学生课堂讨论，结合非课堂教学方式，注重联系实际，强调培养学生分析和解决实际问题的能力。